São coisas diferentes, e misturar as duas é o erro mais comum na hora de decidir.
Garantia de fábrica/loja:
Cobre defeito de fabricação — problema na bateria, na placa, em componentes internos que falharam sozinhos. Não cobre quebra de tela, queda na água ou roubo.
Seguro Portáteis:
Cobre exatamente o que a garantia não cobre: acidentes (queda, água) e roubo/furto. Pra quem carrega o celular pra rua todo dia, essa é a parte que realmente importa — a maioria dos sinistros de celular não é defeito de fábrica, é acidente do dia a dia.